肛門癢有小顆粒可能是以下幾種原因導致的：
1. 痔瘡：痔瘡患者可能會出現肛門部位有腫塊脫出的情況，容易導致粘膜分泌液體增多侵染肛門肌膚，引起肛門部位出現發癢的小疙瘩。
2. 肛瘺：肛瘺主要是由于肛管周圍出現感染形成的慢性瘺道所致，主要癥狀包括肛周部位腫痛、流膿、有發癢小疙瘩等。
3. 尖銳濕疣：尖銳濕疣是由感染人乳頭瘤病毒引起的，肛門部位可能會出現小疙瘩，伴有瘙癢感。
4. 肛周濕疹：如果患者穿著過緊的衣物，肛門局部受到反復摩擦，或進食辛辣刺激性食物，刺激肛周出現分泌物，使肛門局部潮濕，從而引起濕疹，出現紅斑、丘疹樣皮損，也可出現米粒樣疙瘩。
以上幾種疾病需要根據不同的癥狀和病情進行相應的治療，建議及時就醫并根據醫生的建議進行相應的治療。
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