掌骨疼痛的病因主要有以下幾種：1、外傷：是最為常見的原因，日常生活中手部的外傷，如摔傷、擠壓傷，或者其他撞擊傷，發生幾率較高。在外傷的致病因素作用下，可以造成手掌掌骨發生骨折，骨折后會造成局部劇烈疼痛、畸形、功能障礙，嚴重則造成開放性損傷，皆需要手術處理；2、骨髓炎：是發生于骨膜、骨質和骨髓的化膿性炎癥，如果侵犯到掌骨，就可以造成局部的劇烈疼痛，嚴重會伴有骨質破壞、病理性骨折，以及局部膿腫的形成；3、類風濕關節炎：多數侵犯小關節，手掌部位也會被浸潤，尤其是掌指關節部位，可能出現類風濕性滑膜炎，造成關節軟骨破壞、滑膜組織增生，然后掌指關節出現畸形，活動時伴有嚴重疼痛；4、腫瘤：如掌骨上的內生軟骨瘤、骨軟骨瘤，或者其他的惡性腫瘤，皆可以誘發局部疼痛，同時伴有腫塊形成，需要根據病理活檢結果確定性質，然后進行針對性治療。