晨起后肝區隱痛可能與以下疾病有關：1、各種急、慢性的肝臟疾病均會引起肝區不適，甚至隱痛，晨起后癥狀尤為明顯。常見的引起肝區不適或者疼痛的疾病包括病毒性肝炎，例如急、慢性乙型或丙型肝炎，還包括酒精性肝病、藥物性肝炎和自身免疫性肝病等，長期的肝臟炎癥、水腫導致肝被膜受刺激，會引起肝區不適；2、在早晨空腹時，膽囊炎、慢性膽囊炎或者膽囊結石等肝外疾病也會引起肝區不適。肝區是膽囊所在的區域，膽囊與肝臟緊密相連。因此，晨起時自覺肝區不適的患者，需及時就醫，進行肝臟以及膽囊的超聲學檢查，盡早明確肝臟疾病、膽囊炎癥、腫瘤或結石等疾病。臨床還需化驗肝功能以及常見的肝病標志物，包括乙肝五項、丙肝兩項以及甲胎蛋白和CA19-9等肝臟腫瘤標志物，便于進行針對性治療。