頭一陣一陣跳著疼的原因常見為原發性頭疼或繼發性頭疼等，具體如下：1、原發性頭疼：一般多半見于血管搏動性頭疼即偏頭疼，其特點為病史較長，患者有頭疼病史較多年。間斷出現，頭疼發作一次持續4-72小時。部分人睡覺后次日即可恢復，此類疼痛可能為原發性偏頭疼；2、繼發性頭疼：出現繼發性頭疼的原因可為繼發于顱內外的器質性疾病，也可為繼發于全身的系統性疾病，顱內疾病如腦出血、蛛網膜下腔出血、腦部炎癥如腦炎、腦膜炎、硬膜下血腫、頭部外傷引起硬膜下血腫、靜脈竇血栓形成引起顱內高壓、腫瘤及寄生蟲病等都可出現此類頭疼；3、其他：頭面部任何器質性疾病也可引起此類疼痛，如神經疼、顳動脈炎及全身系統性疾病，焦慮、抑郁時也可出現此類現象。