一般凹陷較輕的患者，尤其＜1cm的顱骨凹陷性骨折，對下方的腦組織壓迫較輕微，通常不會遺留很嚴重的后遺癥。但針對凹陷程度比較深的骨折，可能會引發患者出現后遺癥，如可能會引發患者癲癇，但這種外傷性的癲癇可以通過藥物進行控制。如果通過規律服用抗癲癇的藥物進行治療，患者的療效不是很滿意，也可以通過手術的方式解決。顱骨凹陷性骨折引發患者癲癇進行手術之前需要定位，判斷是否為凹陷性骨折導致的異常放電而引發的癲癇，一旦確認則需要進行癲癇灶的切除，可取得較好的效果。另外，部分患者的語言功能可能會受到影響，引起語言障礙，還會導致肢體的運動無力，可以通過術后規范性的康復訓練得以恢復，可得到較好的預后。