一般支氣管鏡能查出部分肺癌，但并不絕對。目前病理診斷仍是腫瘤診斷的金標準，對于中央型肺癌如小細胞癌或鱗癌，當與氣管、主支氣管位置相對鄰近時，通過支氣管鏡檢查，較易鉗取到組織進行病理檢查，從而進行診斷。但肺腺癌等周圍型肺癌，尤其是生長在支氣管末端臨近胸膜處，此時支氣管鏡檢查有一定局限性，因為病灶離主要的支氣管或細支氣管距離較遠，支氣管鏡檢查難以鉗取到病變組織。此時可能要在CT或彩超引導下進行穿刺，以完善病理診斷，再進行后續治療。此外，痰液或胸水的脫落細胞學檢查，以及淺表淋巴結、轉移淋巴結的穿刺活檢，都有助于進行病理診斷。