腫瘤標志物可以通過抽血檢查，也可以檢查手術或者穿刺活檢得到的組織，同時胸水、腹水、腦脊液、心包積液也可以檢查腫瘤標志物。臨床上常用的體液腫瘤標志物，包括甲胎蛋白、前列腺特異性抗原、癌胚抗原、糖類抗原125、糖類抗原19-9、糖類抗原153、神經元特異性烯醇化酶、細胞角蛋白19片段、糖類抗原72-4、人絨毛膜促性腺激素等。通過采取病人的血液、胸水、腹水等體液，可以檢查腫瘤標志物在各種體液中表達的數(shù)值，指導惡性腫瘤的診斷和治療。廣義的腫瘤標志物還包括組織的基因檢測，比如EGFR基因檢測、AMK基因檢測，這些基因的檢測可以彌補體液腫瘤標志物檢查的不足。