亞急性硬化性全腦炎是比較遺憾的病，死亡率較高，大約有80％的患兒可能會在發病1-2年之后癥狀逐漸進展，最后因治療無效死亡。因為現在針對麻疹病毒，沒有特別好的療法，臨床上主要是積極的對癥治療，防止并發癥，比如有癲癇抽搐的患兒，可能會給予抗癲癇的治療，有腦水腫的情況就給予脫水降顱壓的治療。當出現錐體外系癥狀的時候，比如肌張力高，可以給予相應的藥物來治療。 但是總體上來說，這些藥物僅僅是起到支持、對癥治療的作用。針對麻疹病毒的治療，現在沒有特效的藥物，并且預后也比較差，死亡率非常高。所以對于亞急性硬化性全腦炎，應該按照國家的預防措施盡早注射相應的疫苗來減少發生。