甲狀腺疾病需要根據患者的病情來決定掛什么科室進行診斷。以彌漫性甲狀腺腫伴甲狀腺功能亢進癥為例，如果是用內科方法治療，就掛普通內科或者內分泌科，普通內科多見于一、二級醫院，內分泌科多見于三級醫院。如果是需要用手術的方法治療，掛普通外科、頸部外科、甲狀腺科均可以。如果要采用核素碘-131治療，就需要掛核醫學科進行治療。核醫學科只有在三級甲等醫院才具備。而甲狀腺的一些癌癥以及腫瘤結節需要做外科手術，就可以掛外科，需要用藥物治療的就可以掛內科。甲狀腺的疾病一般包括甲狀腺結節、甲狀腺腫瘤、甲狀腺癌以及甲狀腺激素水平分泌異常，如甲狀腺激素分泌過多導致的高代謝癥候群，常見的有彌漫性甲狀腺腫伴甲狀腺功能亢進癥以及甲狀腺激素減少導致的甲狀腺功能減退癥。還有一些甲狀腺的炎癥性疾病，如急性甲狀腺炎、亞急性甲狀腺炎、橋本甲狀腺炎。