前列腺炎的患者可以引起性功能障礙，常見引起的問題是陽痿和早泄。如果是前列腺炎引起的陽痿，其治療主要是控制原發疾病，同時可以應用針對改善癥狀的藥物。控制原發疾病主要是針對前列腺炎本身進行控制，主要的治療藥物包括抗菌素。目前推薦的是喹諾酮類抗菌素，應用較多的藥物是左氧氟沙星。一般應用周期是4-6周，每2周進行一次療效評價。其次根據患者的排尿癥狀、疼痛癥狀等表現，應用α受體阻滯劑、M受體阻滯劑、非甾體消炎鎮痛藥物、植物制劑和中醫藥制劑等進行聯合治療。對于陽痿患者，還可以應用藥物改善癥狀，主要是5型磷酸二酯酶抑制劑，最常用的藥物是西地那非，同時要針對患者的心血管問題進行處理。還要改善患者的心理狀態，因為慢性前列腺炎持續存在，患者可能形成緊張、焦慮等負面情緒，也可能引起相應的勃起功能障礙。早泄的治療也是以控制原發疾病作為主要的治療手段，同時可以應用改善癥狀藥物。改善癥狀的藥物主要是5-羥色胺再攝取抑制劑，目前推薦應用的藥物是達泊西汀。