妊娠期甲狀腺功能減退癥，對胎兒最顯著的影響，會影響其中樞神經系統發育，而這個影響最典型的時期是在妊娠前12周。因為妊娠前12周是胎兒中樞神經系統發育最關鍵的時期，所以對于妊娠期女性，一定要注重監測其甲狀腺功能，尤其是在妊娠前就已患有甲狀腺功能減退癥的女性，要注意最好把甲狀腺功能維持在正常范圍內再去懷孕。一旦懷孕，同樣也要監測甲狀腺功能，如果甲狀腺功能表現為甲減、T4(甲狀腺素)水平降低，有可能會影響胎兒的中樞神經系統發育。T4能夠參與胎兒中樞神經系統的生長，如果缺乏T4，胎兒大腦的功能可能會受到影響，極易發生呆小癥。通常妊娠期甲狀腺功能減退癥的女性，要求每個月復查甲狀腺功能，而其TSH(促甲狀腺激素)常建議至少在4.0mU/L以下，最好能夠達到2.5mU/L以下，T3(三碘甲狀腺原氨酸)、T4水平處在中位數或正常上限，才能盡可能保證胎兒的甲狀腺素供應充足。