兒童測腋下體溫一般要測量不少于5分鐘，只有在5分鐘以上，才能使體溫計與機體溫度達到平衡狀態，準確地反映機體體溫。如果測量時間過短，則無法反映出真實體溫。兒童測腋下體溫一般要使用水銀體溫計，而非電子體溫計，電子體溫計通常是用于測量表面皮膚的溫度，很少用于腋下體溫的測量。但是，隨著人們對重金屬元素毒性作用的認識加深，水銀體溫計的使用已經明顯減少，國家衛健委甚至不再推薦水銀體溫計。若使用水銀體溫計測量兒童腋下體溫，時間不能少于5分鐘。