經直腸做B超的疼痛可以耐受。前列腺是位于膀胱和男性陰莖尿道之間的臟器，位于直腸的旁邊，手指頭通常可以摸的到。正常情況下，如果肛門口沒有痔瘡，沒有肛門口的縮窄，直腸的探頭比拇指稍微大些。在避孕套的外套之下進入直腸，可以較直接地探測到前列腺的大小、體積、質地。如果患者疼痛實在難以忍受，也可以在直腸內注入麻醉劑，如丁卡因膠漿，以減少疼痛的程度。做B超查前列腺有兩種方式，包括經直腸和經腹壁。而觀察前列腺腫瘤的可能性、有無結節、有無異常的回聲，經直腸是比較合適的方式。還有一種就是看生殖系統，如果有射精管的囊腫，有非梗阻性無精癥，也推薦經直腸做B超，更加直截了當。另外也可以做磁共振，包括做CT，也能反映部分情況。