膽結石引起肝功能異常的治療主要是針對膽結石來采取治療。具體如下：1、膽囊結石急性發作：如果炎癥累及肝臟會出現肝功能異常，或者是膽囊內結石掉入膽囊管引起膽道梗阻、膽汁淤積，繼而出現黃疸和肝功能異常。無論是哪種情況都建議盡早通過外科手術干預，包括膽囊切除以及膽管切開取石來恢復膽道的通暢性、減少膽囊及膽管炎癥對于肝臟的損傷，可以較大限度地改善肝臟功能；2、慢性膽囊結石：慢性膽囊結石引起的慢性膽囊炎或者是無癥狀膽囊結石通常不會合并肝功能異常，如果體檢的時候發現轉氨酶異常升高，則需要考慮是否有其他疾病，包括病毒性肝炎、長期飲酒、嚴重脂肪肝、某些藥物以及自身免疫性肝臟疾病引起的肝功能異常。此種肝功能異常不是由于膽囊結石引起，而需要根據具體的病因來采取相應的其他藥物治療。