肛裂在臨床治療分保守療法和手術療法。如果新發肛裂，疼痛不劇烈，時間在1個月之內，可以用藥膏來治療。而反復發病、時間較長，如幾個月甚至更長時間，以及排便后肛門疼痛劇烈和有手術指征的患者，藥膏療果差，不建議使用。 治療肛裂有很多藥物可選擇，包括目前市售的大部分痔瘡膏，還有西藥里面的硝酸甘油軟膏等，涂抹到傷口和肛門局部，對治療肛裂有一定療效。但一般不建議患者自行選用藥膏來治療，患者應先到正規肛腸科就診，明確診斷，以確定保守治療是否有效，之后再用藥膏治療。在治療肛裂時并不單純采用藥膏治療，可能會聯合其它療法，比如中藥熏洗、坐浴，局部用藥膏、藥栓等聯合用藥，效果可能更理想。