脂肪膠填充淚溝的弊端其實和脂肪膠或者是其它的材料，如玻尿酸、膠原蛋白、自體脂肪填充淚溝的弊端都一樣。由于脂肪膠不會完全存留在體內，而是逐漸的被自身的組織刺激、增生來填充淚溝，所以脂肪膠填充過度的現象相對要好很多。但是由于脂肪膠要在離體的狀態下，放置兩周左右的時間再進行填充。這期間很容易保持不了無菌的狀態，也就是在非正規的機構，很容易導致脂肪膠出現感染的問題。一旦出現感染的問題，就是將含有細菌的液體或者是脂肪膠的混合物，注射到相應的淚溝位置，就會導致淚溝位置的感染非常嚴重，就會導致流膿、淌水的現象。如果想要治好勢必要進行切開引流，就會在淚溝的位置形成永久的疤痕。脂肪膠填充是一個看上去非常簡單的操作，但是里面的各種操作原理非常嚴格，如果不按照正常的無菌術進行，一旦感染無法進行修復，因為疤痕一旦形成就無法徹底消失。