注射瘦臉針最主要的副作用為過敏反應，通常類似于疲勞、感冒等癥狀，個別嚴重患者可能會出現呼吸困難、于暈厥等肉毒素中毒癥狀，但這種概率非常小，大部分患者注射瘦臉針后，并沒有過敏反應。有時由于瘦臉針注射的位置不同，可能導致臉頰出現凹陷，局部肌肉消除不均勻，形成局部凹陷的情況。如果出現面中部凹陷，通常可以通過時間逐漸恢復，如果比較嚴重的面部凹陷，通常可以局部適當補打瘦臉針肉毒素，使鼓出的肌肉消下去，從而達到改善的效果。