丙酚替諾福韋和恩替卡韋都是抗乙肝病毒的藥，都可以在臨床治療中使用。丙酚替諾福韋是最近才出現的新型抗病毒藥，優勢在于療效更好、耐藥率更低，所以對部分有恩替卡韋耐藥性的病人可以選擇丙酚替諾福韋。另外，從療效方面，恩替卡韋不如丙酚替諾福韋，丙酚替諾福韋的療效更好、更快。但是在臨床上，上述藥物都可以選用，已經選擇恩替卡韋的患者繼續用恩替卡韋進行抗病毒治療。如果對恩替卡韋耐藥，可以換用丙酚替諾福韋，也有部分患者對恩替卡韋、替比夫定、拉米夫定一類的抗病毒藥都存在耐藥現象，此時可以直接選用丙酚替諾福韋進行治療。