調節神經功能紊亂的藥物有很多種，具體情況如下：1、抗焦慮抑郁藥：很多的神經功能障礙，包括交感神經過度興奮等，引起的心慌、氣短、胸悶、腸道功能紊亂、出汗等，都和焦慮抑郁情緒有關系，因此可以用抗焦慮抑郁治療的方法來進行改善。常用的抗焦慮抑郁的藥物，包括氟哌噻噸片、文拉法辛、艾司西酞普蘭等，以及其它的一些SSRI類的藥物；2、改善睡眠的藥物：相當一部分自主神經功能紊亂，是因為睡眠不好而引起來，如苯二氮?類的藥物、安定類的藥物，以及非典型的藥物，如右佐匹克隆等，都可以幫助改善睡眠，甚至一些特殊的藥如米氮平，三唑侖類的藥物，都可以幫助改善睡眠的狀況。此外，還有一些藥物是針對癥狀來改善，如患者更容易出現心慌的癥狀。對于心慌的患者，可以給予更多的美托洛爾、普萘洛爾等藥物進行控制，可以得到癥狀性的改善，從而達到治療或者調節神經功能障礙的作用。