免疫組化是病理檢查最常用的一種方法，宮頸病變也經常會做免疫組化。宮頸免疫組化確診通常最多見的是宮頸鱗癌、腺癌，其較容易診斷，不需要做免疫組化； 分化較差或者病變不典型的，需要借助免疫組化來判定其組織學類型。通常低分化的鱗狀細胞癌會表達CK56、P40等；腺癌通常會表達CK-7、CEA；小細胞癌會表達CD56、CgA等； 淋巴造血系統的惡性腫瘤會表達LCA、CD20等。宮頸活檢時會建議病人做P16和Ki-67雙染，因為宮頸活檢時，正常宮頸細胞P16和Ki-67不會同時染色。 如果P16和Ki-67同時染色，表明此病變是高危型HPV感染，這就要引起臨床重視，需要臨床再進一步檢查，如做錐切或者局部切除或者利普刀手術。