枕大池囊腫通常考慮為先天發育異常導致，因為神經管發育、吸收不完全，遺留而導致枕大池囊腫，可在枕大池看到擴大或囊性物質。通常情況下屬于良性病變，不會出現壓迫，沒有癥狀，可不予干預，極少數患者因繼續生長發育而使枕大池囊腫自動吸收、消失。如果枕大池囊腫逐步增大，可能出現壓迫癥狀，如果壓迫到小腦腦干，可出現相關功能障礙，如共濟失調、言語功能障礙、吞咽困難、飲水嗆咳等，需進行手術治療，此時可通過囊腫引流術或枕大池囊腫摘除術有效去除壓迫以改善癥狀。還可能因導致腦脊液循環障礙，患者出現腦積水癥狀，表現為共濟失調、癡呆，甚至出現顱內壓增高，引起頭痛、惡心、嘔吐等，這時也需進行手術治療。