細菌霉菌混合性陰道炎即陰道同時被細菌和真菌感染，故治療時比較棘手，也比較麻煩。因為治療細菌感染用的是抗生素，而用抗生素可能會加劇霉菌性陰道炎癥狀。所以，這種情況一般要分開治療。陰道局部用藥時可用抗真菌藥，比如制霉菌素、達克寧等抗真菌藥，局部治療真菌性陰道炎。至于細菌性陰道炎，可以口服抗生素。經過上述治療，兩個病通常都可達到比較好的治療效果。 在抗炎治療以后還可以放乳酸桿菌調節陰道菌群，因為乳酸桿菌對陰道是保護性細菌，乳酸桿菌可使其它致病菌不容易滋生，如此就可以更好的維護陰道細菌內環境達到菌群平衡狀態，可以增加陰道自身抵抗力。