自然流產的原因有很多，有可能是胚胎問題、母體原因、藥物原因或者是環境原因。具體如下：1、胚胎問題：自然流產的原因很多，其中最主要的原因，50%左右可能是胚胎的問題，尤其是胚胎的染色體異常，比如以非整倍體最為常見，常見的有16號、22號三體或者X單體；2、母體原因：也有可能是母體的自身疾病，比較常見的原因有內分泌異常，比如合并血糖沒有控制好的糖尿病、甲狀腺功能亢進或者甲減、多囊卵巢綜合征、高泌乳素血癥，可能會導致流產。還有可能是免疫系統的問題，比較常見的有自身性免疫性疾病，比如紅斑狼瘡、未分化結締組織病等，還有抗磷脂綜合征。也有可能是凝血異常，比如抗磷脂綜合征或者體內的高凝狀態。還有可能是母親的子宮解剖異常，子宮畸形在臨床上最為常見的是縱隔子宮，也見于單角子宮、雙角子宮等；3、藥物原因：也有可能是藥物原因，比如毒品，或者抽煙、酗酒，都有可能會導致流產；4、環境原因：比如毒物、放射線、化學物質、重金屬，比如汞、鉻等，也可能會導致流產。