咽炎不會影響核酸檢測，因為核酸檢測是通過獲取呼吸道的標本，檢測呼吸道標本中含有病毒的特異性病原體及特異性基因序列來發現病原體。不管咽炎是何種病原體感染所引起，在檢測時均有目標病原體，如做新型冠狀病毒核酸的檢測，僅觀察標本中有無新型冠狀病毒特異性的基因序列存在，其他感染性的病原體不會影響標本中目標病原體的檢測，故咽炎不會影響核酸檢測。不管咽炎類型為慢性、急性或非特異性、感染性，在獲取呼吸道標本時，均是在咽部獲取呼吸道標本。但在取核酸咽拭子標本前，注意不要咀嚼口香糖，因咀嚼口香糖可使咽部局部的內環境發生改變，導致獲取的呼吸道標本質量下降，可影響核酸檢測的結果。