小兒先天性心臟病會有以下危害：1、肺炎：這類小兒抵抗力較低，易合并肺炎。反復肺炎可以導致間質性肺疾病，甚至出現呼吸衰竭；2、加重心臟負擔：反復的心內血液分流會引起心臟結構和功能改變，甚至出現心臟擴大、心力衰竭，或者發生艾森曼格綜合征；3、心律失常：易出現快速性或者緩慢性心律失常，嚴重時會引起心源性猝死；4、感染性心內膜炎：因為自身存在先天的心臟結構缺損，一旦發生感染時，容易合并感染性心內膜炎。一旦出現嚴重的感染性心內膜炎，會加重心臟耗氧或者加重心臟負擔，誘發心力衰竭的發生；5、臟器栓塞：如果心臟內有細菌的贅生物形成，一旦贅生物脫落，會導致各臟器出現不同程度的栓塞或梗死的表現，嚴重者也可以出現生命危險。