出血熱疫苗要根據感染漢坦病毒的不同毒株決定，其注射的時間點也會不同。如果在野外地區感染流行性出血熱，使用Ⅰ型出血熱的疫苗，注射時間在感染的當天、感染的7天、14天、28天及6個月分別進行注射，通常為滅活疫苗。如果在家內感染出血熱的病毒，可使用Ⅱ型的滅活疫苗，注射的時間在感染的當天、感染的第28天，即1個月，還有感染后的1年，注射3次即可。Ⅰ型疫苗和Ⅱ型疫苗之間，具有相互交叉免疫的保護性。如果在野外感染后注射Ⅰ型疫苗，在家庭內再出現感染，其實有一定的交叉保護性，需要根據感染病毒的時間和感染病毒量進行判斷。反之亦然，如在家感染流行性出血熱后，在野外再次感染時也要進行評估，以判斷是否需要再注射疫苗。