肛門有水流出一般是由于肛門關閉不全，使肛門內分泌物通過關閉不全的肛門流到肛門外引起。導致肛門功能障礙的原因大多數是和肛周疾病相關，比如肛瘺、肛裂、痔瘡、息肉等，容易造成肛門關閉不全或者關不嚴的情況。這時肛內分泌物會通過關閉不全的肛門流到肛門外，而肛瘺患者可以有分泌物直接從直腸內流到肛門周圍，形成比較難以忍受的濕疹和瘙癢。當出現肛周有流水情況時，要判斷是否有肛周疾病，可以通過直腸指診或肛門鏡等檢查，發現以及明確相關病變，必要時可通過病理活檢明確腫物性質。對于痔瘡、息肉等疾病，應積極治療原發病，而息肉只能進行手術切除。肛瘺、肛裂等炎癥性疾病大多數情況下不能通過抗生素治療，只有進行手術切除，使新生肉芽組織由內向外生成，炎癥才能控制，癥狀會逐步好轉。