做卵巢B超什么時候檢查最好，要取決于是什么目的去做卵巢B超，具體分析如下：1、檢查卵巢囊腫：建議在月經剛剛結束這段時間去查B超，而且最好要查陰式B超。因為在月經剛剛結束時，不會有生理性囊腫的干擾。所謂的生理性囊腫，是指月經周期中有可能正常出現的囊腫。一般在黃體期，下次要來月經之前，比較容易出現生理性囊腫，也就是黃體囊腫。而在月經中期時，在排卵期有可能會把要排卵的卵泡當成囊腫。排除這些生理性的情況，所查到的囊腫才是真正的囊腫；2、檢查卵泡數量：一般在月經來潮，就是來月經血的第5天檢查，也就是在第2-5天檢查卵巢里的基礎卵泡數量；3、監測排卵：一般是從月經見血的第1天開始數，差不多從第12天開始，隔天進行陰道超聲。檢查卵泡生長發育的情況，直至排卵出現。這是卵巢B超在不同情況下，不同目的時，需要不同的時間去檢查。