B超是檢查子宮和卵巢非常好的手段，婦產科碰到問題時首先會想到做B超。所以子宮內膜異位癥能夠通過B超檢查，因為子宮內膜異位在周圍器官可造成癥狀，包括子宮肌層、卵巢、盆腔等。如在肌層，會表現為子宮異常增大，局部累及的病變部位回聲比較雜亂，但是團塊狀不是特別明顯，需要與子宮肌瘤鑒別。子宮肌瘤有明顯的邊界，而子宮內膜異位的邊界不是特別明顯，再結合本身痛經的癥狀，就可以診斷是子宮內膜異位。其次，子宮內膜還可以發生在卵巢上，在做B超的時候可以發現單側或雙側有囊性包塊，而囊性包塊里的透聲比較差，是因為不停有周期性出血淤積在里面，都是血液的沉積，導致透聲非常差。 當看到這一類的典型圖像，就可以診斷為子宮內膜異位癥，如發生在卵巢，又叫巧克力囊腫。但發現卵巢里面有囊性包塊，還要和其他類似的疾病所鑒別，如常見的黃體囊腫、卵巢畸胎瘤等，可通過超聲的特點進行綜合的鑒別診斷。 總體而言，子宮內膜異位癥在B超顯示中非常敏感。