實際進口的乙肝疫苗和國產的乙肝疫苗，從不良反應以及免疫成功率而言，均沒有明顯差別。目前進口的乙肝疫苗進口是安在時，為葛蘭素公司所生產，一針20mg。而國產的乙肝疫苗，一種是重組酵母細胞乙型肝炎疫苗，另一種是重組中國倉鼠卵巢細胞乙型肝炎疫苗。其中重組酵母細胞一般為10μg/針，中國倉鼠卵巢細胞疫苗一般為20μg/針。按正規免疫程序接種后，即0、1、6的免疫程序，95%的人均能夠產生乙肝的保護性抗體，且抗體持續時間相對較長。此外進口的乙肝疫苗和國產的乙肝疫苗，均會產生一般性的不良反應。如注射后可有注射位置的紅腫、硬結、疼痛，同時患者可能出現發熱。通常為低熱，還可伴隨著發熱，有肌肉關節的疼痛、倦怠、乏力、頭痛等不適。但上述不良反應，通常在1-3天左右就會自行消失，不需做特殊處理。