多數患者在切除畸胎瘤后可以正常生育，但部分患者切除后可能會影響生育。如果男性患者的雙側睪丸都有腫瘤，將其切除后可能會影響生育，對于女性患者而言，如果雙側卵巢都發生腫瘤，將其切除后也會影響生育。但一般畸胎瘤發生在雙側的幾率較小，通常都是單側畸胎瘤，此時對單側卵巢或單側睪丸進行切除，如果對側卵巢和對側的睪丸功能正常，術后患者依舊可以生育。此外化療過程中的環磷酰胺對睪丸的生精功能可能有一定影響，如果患者患有惡性腫瘤，需要進行大劑量的環磷酰胺化療，對于男性患者而言，可能產生無精癥影響生育功能，通常大量環磷酰胺對女性患者的影響較小，不影響生育功能。另外需要注意的是，生育是比較復雜的過程，除腫瘤外還有多種原因會影響到生育功能，因此還需要結合具體情況綜合分析。