甲溝炎發作及預防都要使用碘劑，其中包括碘伏、碘酊，兩者都有殺菌作用但是又有所不同。其中碘伏不含有酒精，主要是殺滅細菌，而碘酊含有酒精的同時具有酒精的殺滅作用，但是碘酊的刺激性要比碘伏更強。所以如果患者患有的甲溝炎局部有傷口，為減少對傷口的刺激，建議使用比較溫和的碘伏。如果是局部腫脹非常明顯并沒有傷口，使用碘酊時可以產生酒精的消腫作用，兩者各有利弊。因此，如果患者的甲溝炎有紅腫的炎癥肉芽，使用碘酊的時候可能會因為酒精帶來傷口刺激而產生不適感，所以碘伏相對比較柔和，對傷口的刺激和疼痛感相對比較微弱。但由于碘伏比碘酊更普及，所以在日常的甲溝炎的消毒中，患者使用碘伏即可。如果想具有更強的殺菌能力和消毒能力，可以使用碘酊，但需注意碘酊對傷口刺激的不良反應。