4價疫苗和9價疫苗在預防HPV感染的種類存在不用，4價預防4種HPV的病毒，包括6型、11型，容易產生尖銳濕疣，還有16型和18型。9價疫苗是在這4型之外多了5個，包括31型、33型、45型、52型和58型，區別在于預防病毒種類會不一樣。同時也在不同人群中做的試驗，人群數據也是不太一樣。如4價疫苗的人群數據到45歲以下都可以，而9價疫苗的數據在9-26歲的年輕女性。9價疫苗可能就只能為26歲以下的女性注射，但如果想注射4價疫苗，45歲以下均可。