根尖囊腫手術后局部會有腫脹反應，根尖囊腫的手術局部一般都會有腫脹，一般1周左右就會消退。若是用微創手術，如顯微根尖手術可能3-5天就會消退。但牙槽骨完全恢復則需要3-6個月，并且還需通過X線片確認殘余骨腔是否被牙骨質填充。此外，整個根尖囊腫手術的恢復大約要1年。因此，患者不要著急，術后一定要保證口腔衛生、清潔，而且要正確用藥、正確飲食，如避免辛辣刺激的食物、多補充維生素、不要吃過硬的食物等，因為過硬的、辛辣刺激的食物會刺激黏膜。遵循上述事項有助于消除腫脹以及手術切口愈合。一般在術后7-10天醫生會要求患者拆線，此時還需再次進行檢查。