乙肝全稱為乙型肝炎，一般乙型肝炎在免疫耐受期不會持續一輩子。在嬰幼兒時期感染時，免疫識別功能相對比較低，會將乙型肝炎病毒認為是自身的物質而接納，乙型肝炎病毒會出現免疫耐受的狀態，表現為乙型肝炎病毒和肝細胞和平共處，乙型肝炎病毒靠肝細胞的營養存活，但也不破壞肝細胞，稱為免疫耐受期的狀態。隨著時間的逐漸延長，免疫識別功能逐漸健全，終有一天會識別乙型肝炎病毒不是自身的物質，對乙型肝炎病毒發動進攻。此過程結局是兩敗俱傷，表現為乙型肝炎病毒的數量降低，但是以損傷肝細胞為代價，導致肝功能異常，即乙肝清除期，在清除期進行抗病毒治療是比較理想的狀態。因此極少部分病人的肝功能一直正常，雖然肝功能正常，但影像學可能有變化，已經出現肝硬化等狀態。