打完HPV疫苗第二天來月經不會影響疫苗的效果，因為HPV疫苗是通過注射減毒的HPV，然后刺激機體產生對HPV的抗體，從而達到預防宮頸癌的目的。HPV抗體的產生與機體接受的HPV疫苗有關，與月經來潮是沒有關系的。注射完HPV疫苗，機體的免疫系統開始行動，產生對HPV的抗體，從而可以預防HPV的感染。通過預防HPV的感染來預防宮頸癌，達到有效的制約和控制HPV感染的作用。HPV疫苗是目前來講可以預防宮頸癌最有效的方法，所以適齡的女性都應該注射HPV疫苗，可以減少宮頸癌的發生。但是注射完HPV疫苗以后仍不能掉以輕心，仍需進行宮頸癌的篩查，避免其他類型的HPV感染，導致宮頸癌的發生。