女性腎囊腫的發生原因目前未十分明確，但是女性腎囊腫和男性腎囊腫發生機理基本一致，并未發現腎囊腫在女性當中的發生率較高。腎囊腫分為單純腎囊腫和多囊腎，具體病因如下：1、單純腎囊腫：單純腎囊腫的發生機理并非十分明確，主要由于遠曲小管或近曲小管的膨脹，或者囊性病變引起。通常治療單純腎囊腫以手術治療為主，沒有任何藥物或者其他治療方法可以進行干預；2、多囊腎：屬于常染色體疾病，包括顯性遺傳和隱性遺傳。如果為顯性遺傳的腎囊腫，發病較晚，通常在30歲以后發病，而且如果管理得當的患者，基本上對生存期沒有任何的障礙；如果為隱性遺傳的多囊腎，通常起病較早，患者生存的年限較短，患者可能在后期需要進行透析治療，因為患者的腎臟會變逐漸生成很多囊腫，最終失去功能。