月經期間細菌性陰道炎可以口服甲硝唑來治療。細菌性陰道炎是由于陰道局部菌群失調所導致，如果在某些情況的作用下，乳酸桿菌等優勢菌減少，加德納桿菌等雜菌增多，就會出現細菌性陰道病，也就是細菌性陰道炎，此時需要使用相應的治療。細菌性陰道炎患者可以口服或者陰道使用甲硝唑或者克林霉素的相關藥劑，也可以同時使用能夠促進乳酸桿菌恢復，含有乳酸桿菌的陰道膠囊。但是在月經期間，由于有經血流出，無法進行陰道上藥，只能采用口服用藥，此時就可以在醫生指導下口服甲硝唑7-10天。等到停藥后3-7天，月經通常也已經結束，此時便可以進行復查。如果病原微生物轉為陰性，線索細胞消失，則代表臨床治愈，否則可能需要改用其他方法，比如陰道上藥或者是口服其他藥物來治療。