腦損傷的后遺癥恢復較差，后遺癥通常指疾病穩定后殘留的癥狀，常發生在腦損傷6個月后，比如車禍傷急性期的治療較為關鍵。如果效果不好，后期會遺留偏癱或癲癇發作，偏癱和癲癇發作治療較困難，癲癇可以通過藥物進行控制，比如服用抗癲癇藥物，控制發作，不能治愈。對于腦損傷的疾病，應特別注意急性期的治療。急性損傷期存在可以修復、沒有死亡的腦細胞，這些細胞可以被拯救。急性期腦部的內環境紊亂，可能有炎癥或者其他因子，調控時可能會減少損害性因子，增加保護性因子，從而給腦部較多機會進行修復和代償。急性期修復和代償可以起到治療作用，如果形成后遺癥，想恢復比較困難。