男性泌尿系統疾病的病因是一個比較廣泛的范疇，因為在泌尿外科，泌尿系統的常見疾病包括泌尿系統的感染、結石、結核、腫瘤、畸形、損傷以及血管問題等，具體如下：1、泌尿系統感染：一般是由細菌感染引起，感染的方式為逆行感染、血行感染或者直接蔓延，以逆行感染最為多見。除細菌感染，還可見于其他病原微生物的感染，如支原體、衣原體；2、泌尿系統結核：需要注意一些特異性的感染，最常見的特異性感染就是泌尿系統結核，屬于結核桿菌的感染引起，為血行感染，通常會感染腎臟而引起下尿路結核的發生；3、泌尿系統結石：也是一個常見的疾病，但發病病因比較復雜，通常是由于外界因素、個體因素、泌尿系統因素的共同作用，使尿液中的成石因素增加，而抑石因素減弱，從而導致尿液中有形成成分析出，繼而引起結石的發生；4、泌尿系統腫瘤：其發病病因更為復雜，泌尿系統腫瘤最常見的包括腎癌、膀胱癌和前列腺癌，這是位于前3名的泌尿系統腫瘤。腫瘤的發生病因目前并不清楚，一般認為外界因素與內在的基因變化相關；5、泌尿系統畸形：畸形一般是由于先天性或者遺傳性的因素，而導致泌尿系統發育異常引起；6、泌尿系統損傷：顧名思義就是由于外傷所導致的泌尿系統問題。