懷孕90天可以流產，建議住院藥物流產。懷孕90天，這時候相當于已經懷孕13周左右的時間，也基本上已經進入中期妊娠的范疇。這時候不建議做手術的終止妊娠。手術終止妊娠又叫做鉗刮術，現在已經做得非常少，因為鉗刮術，對母親的子宮損傷比較大，手術當中出血宮頸裂傷的風險增加，也容易在手術過后出現胎骨還有排污殘留，導致二次的清宮，手術過后宮腔粘連的風險，還有盆腔感染風險就會增加。因此不建議這么大孕周手術終止妊娠，而建議住院考慮藥物流產。藥物流產一般考慮選擇米非司酮配合米索前列醇，用藥需要3天左右時間，藥流之后需要看胎盤胎膜排出的是否完整，必要時需要復查B超，如果有胎盤的殘留或者B超有殘留，這時候可能需要清宮術。清宮術手術的風險也要比直接的鉗刮術風險要小很多，所以懷孕90天可以住院藥物流產。