懷孕初期先兆流產的原因常見為偶發性激素水平波動及情緒因素等，具體如下：1、偶發性激素水平波動：大部分情況可能為偶發性的激素水平波動，如黃體功能不足、孕激素水平分泌不足。此階段有可能會有輕微腹痛，會有輕微的、少許的、點滴的陰道出血。但大部分情況下，補充黃體酮治療或充分增加休息后，大部分妊娠可持續。有資料表明若既往無反復多次的流產史，可不用給予任何黃體酮支持治療。此類先兆流產，更多可能與體內激素水平分泌出現一過性波動有關；2、情緒因素：孕婦本身出現緊張、焦慮的情緒、休息不好、睡眠不好或過于勞累等，可能也為導致先兆流產的原因；3、基因染色體問題：可能為胚胎本身生長發育過程中，基因染色體的問題導致出現先兆流產，此情況下應給予充分的保胎處理，但在未來較可能不可避免發生流產；4、孕婦本身患有疾病：孕婦本身患有疾病，如高血壓、糖尿病、血糖控制不好、心臟功能衰退、腎功能低下、抗磷脂綜合征或風濕免疫科疾病等。此情況下，也易導致發生先兆流產。