9價疫苗的不良反應很少，通常為局部的紅腫、刺痛，有時會出現腫脹、感染，也有部分人會過敏，均是比較常見的副作用。其他嚴重的副作用，實際上在疫苗被研發出來及上市十數年的時間內，沒有特別明確會造成不孕，或其他嚴重的神經系統疾病。9價疫苗相對安全，從目前看到的不良反應講，常見還是局部的紅腫、過敏、疼痛，及部分出現皮疹等，均屬于輕微的反應，均可在一段時間后，自行消退、緩解、消失。沒有明確的報告證明，還有什么其他的副反應，應該相信不良反應的報告，在全球范圍內成網，任何地方發生的不良反應，均要求必須上報，并且要負法律責任。如果沒有在說明書上標注，通常可認為這種可能性很小，大家不需要過分緊張和焦慮。