治療尿痛主要是針對病因，大多數尿痛是泌尿生殖系統感染造成。女性比較常見的有下尿路感染、尿道炎、膀胱炎，男性常見的是尿道炎、膀胱炎、前列腺炎，這類疾病均可以導致尿路刺激癥狀，如尿頻、尿急、尿痛，在臨床上感染性疾病可以采用抗感染治療。治療藥物以抗生素治療為主，可以根據經驗選用常用抗生素，如氟喹諾酮類、頭孢類、大環內酯類等藥物。必要時也可根據細菌藥敏的結果，選用適宜的抗生素。對于泌尿系統其他疾病所引起的尿痛，如泌尿系統結石、腫瘤、損傷、異物等，可以在完善相應檢查情況下，針對原發疾病進行治療。必要時也可以采用輔助改善癥狀的藥物，如非甾體類抗炎止痛藥、M受體阻滯劑等進行治療。