與鼻咽癌發生有密切關系的微生物主要是病毒感染，主要指EB病毒。EB病毒感染是目前被證明最多的與鼻咽癌發生有一定關系的病毒，和鼻咽癌的發生、發展甚至復發都有一定關系。因此，病毒抗體監測在鼻咽癌治療過程中十分必要，但并非有EB病毒感染就一定會發生鼻咽癌。EB病毒感染非常常見，類似于感冒病毒，但導致鼻咽癌的情況畢竟是極少數，因此無需過于擔心。如果實在擔心，發現EB病毒感染后可以做鼻炎內鏡檢查，確定排除鼻咽癌即可。通常只有EB病毒感染抗體滴度逐漸升高時，才需要注意鼻咽癌發生或者鼻咽癌復發的，一般性的感染問題并不大。此外鼻咽癌還與遺傳因素、接觸熏制類、腌制類食品、其它病毒感染、地域等有關，如廣東祖籍，目前發病率也相對較高。