嬰幼兒中耳炎診斷后，主要是針對病因治療。最常見病因如上呼吸道感染、發炎，病毒性感冒需針對抗病毒治療，化膿感染要針對細菌感染治療。另外，最常見原因是腺樣體肥大、腺樣體炎癥，要針對局部病變治療，鼓膜充血要局部滴藥治療。 化膿性炎癥，耳道有分泌物、流膿，抗生素或者消炎藥不能代替局部清洗。另外，鼻子和耳朵通過咽鼓管相通，主要用于引流，一旦阻塞或者發炎，會引起急性中耳炎，所以咽鼓管功能治療，要充分引流。