如果吃完避孕藥肚子疼，是由于避孕藥含有大量激素，體內內分泌急劇變化，使內分泌激素的靶器官，即子宮，產生不規律收縮，子宮不規律收縮會產生疼痛。避孕藥因為含有大量激素，可以抑制子宮內膜的蛻膜樣轉化，抑制受精卵著床，起到避孕作用。口服緊急避孕藥后由于激素水平突然較高，可以引起撤退性非月經出血，產生子宮收縮，產生肚子疼。避孕藥存在較多副作用，尤其是緊急避孕藥，可以使內分泌改變，造成月經不調，甚至不孕不育，造成異常子宮出血、盆腔炎癥，患者出現惡心、嘔吐、頭暈等早孕反應。患者服用避孕藥后應注意自己的情況，不到萬不得已盡量少服用緊急避孕藥。