男性尿道炎通常包括淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎，致病菌都是由于細菌或者支原體、衣原體、滴蟲、霉菌等感染所造成。藥物是以抗生素治療為主，根據經驗可以選用頭孢類、喹諾酮類、大環內酯類的抗生素，也可以根據進行的藥敏結果選用合適的抗生素。對于尿道炎合并臨床其他的癥狀，如尿頻、尿急、排尿困難、排尿分叉、尿不凈以及疼痛，包括盆腔的疼痛，腰部、會陰、尿道等疼痛癥狀，也可以采用止疼的藥物，如非甾體止疼藥、阿片類止疼藥，或改善尿頻癥狀的藥物，如M受體阻滯劑托特羅定，或β3受體激動劑米拉貝隆，也可以采用理療、飲水等方法針對性的進行治療。尿道炎有時難以與前列腺炎相區別，可以根據尿道常規、尿培養、前列腺液等相應的檢查進行區別和判斷，然后針對性的治療。