骨巨細胞瘤主要好發于20-40歲的人群，太年輕或太年老的人，一般不會考慮骨巨細胞瘤。最常見的發病部位是膝關節周圍，特別是股骨的遠端和脛骨的近端。除此之外，橈骨遠端和肱骨近端有時也會發生。骨巨細胞瘤在四肢的小骨、骨盆和脊柱上的發生概率較低，但也有可能發生，臨床上肋骨和肩胛骨等部位的發病概率更低。所以骨巨細胞瘤的發病部位主要圍繞膝關節周圍，而在顱骨、胸骨等特殊骨頭部位的骨巨細胞瘤，發病則相對較少。