附睪炎不治療，自愈的可能性通常比較小。尤其是急性附睪炎，通常臨床上可以表現為急性附睪腫大、疼痛，以及可能會引起附睪睪丸炎。全身的臨床癥狀也比較明顯，如發熱、寒戰，也可以有排尿的癥狀，如尿頻、尿急、尿痛。這種情況，必須及時給予抗生素的使用，抗生素使用周期，相對比較長。而且可以使用靜脈抗生素，而對于慢性附睪炎，甚至對于一些特異性的細菌感染附睪炎，如結核菌感染的附睪炎，不僅要給予充分的藥物治療，抗細菌或是抗結核桿菌。而且必要時形成附睪結節，遷延不愈的慢性附睪炎，年齡比較大，沒有生育要求時，也可以考慮進行附睪切除術。因為附睪炎有可能會繼發其他生殖系統病變，而且會引起反復癥狀，遷延不愈。有時也會合并前列腺炎等，在臨床上應積極給予治療。